光是生物赖以生存的物质基础。光不仅是植物生长发育的重要能量来源，更是调控植物生长发育的直接参与者。光调控植物生长发育的过程称之为光形态建成（在拟南芥中表现为下胚轴伸长受到抑制、顶端弯钩消失、叶绿体发育等）。COP1 (CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 1)是植物光形态建成的核心负调控因子。COP1作为E3泛素化连接酶，通过泛素化并降解一系列底物，来抑制光形态建成。此外，COP1还广泛参与并调控了植物的开花、气孔发育、生物节律等一系列过程。因此，COP1功能的正常发挥对于植物的生长发育至关重要。为了鉴定更多的COP1信号转导的路径，研究人员对cop1-6突变体（弱突变体）进行EMS诱变，进而筛选黑暗条件下能够回复cop1-6突变体组成型光形态建成表型的遗传抑制子。对筛选得到的13个显性cop1-6抑制子一一进行了基因定位和全基因组重测序，共克隆得到了6个显性cop1-6抑制子基因（DCS1-DCS6）。相关成果已于近日发表于国际知名期刊NatureCommunications上。

内含子保留（intron retention, IR）是植物中最常见的选择性剪接事件。IR在基因表达调控中起着重要的作用。研究发现，内含子保留的转录本（intron-retained transcript, IRT）通过滞留在细胞核中，避免被翻译成新的蛋白或被降解，而这些被储存在细胞核内的IRT在外界信号刺激或发育阶段改变的情况下，能够被剪切加工后出核翻译成蛋白，从而在转录后水平通过控制IRT的剪切来快速响应外界信号以协调植物的生长发育。     

    

本研究表明，COP1参与了光介导的mRNA选择性剪接（主要是IR）过程来协调拟南芥幼苗的光形态发育。光通过对光信号通路成员编码基因（如PIF4，RVE1和ABA3）IR的调控来实现对拟南芥幼苗的光形态建成的精细控制，而这一过程依赖于COP1，并且受到了剪接复合体的调控。本研究中鉴定到的DCS1-DCS6蛋白均为拟南芥剪接体的组成部分。COP1通过直接与植物剪接体特异性组分蛋白DCS1相互作用并使其泛素化降解来调节剪接复合体的功能状态。因此，本研究揭示了光-COP1-剪接体模块调控植物光形态建成的全新分子机制。    

南方科技大学周华研究助理教授为本文第一作者，邓兴旺院士为通讯作者。南方科技大学为第一作者单位，北京大学现代农业研究院是第二单位，北京大学现代农业研究院秦国臣研究员，博士研究生曾海越，研究助理付颖参与了该研究工作，参与该项研究的合作单位有西南大学、南京农业大学、兰州大学、南京师范大学、华南农业大学、美国布鲁克海文国家实验室、海南省农业科学院。该研究得到了国家自然科学基金委、北大-清华生命科学联合中心、南方科技大学以及深圳市科技计划项目等资助。

论文链接：

https://www.nature.com/articles/s41467-024-49571-9